1. Raskere forskning
I stedet for å vente lenge på eksperimentelle strukturer, kan forskere få en god prediksjon tidlig i prosjektet og prioritere hvilke hypoteser som bør testes videre i laboratoriet.
Google DeepMind + EMBL-EBI
AlphaFold er et AI-system som kan forutsi proteiners 3D-struktur fra aminosyresekvensen. I dag gir AlphaFold Protein Structure Database åpen tilgang til over 200 millioner prediksjoner for forskning i verdensklasse.
AlphaFold DB er et samarbeid mellom Google DeepMind og EMBL-EBI. Målet er å gjøre avanserte strukturprediksjoner fritt tilgjengelig, slik at forskere raskere kan forstå proteinfunksjon, sykdom og biologiske mekanismer.
I stedet for å vente lenge på eksperimentelle strukturer, kan forskere få en god prediksjon tidlig i prosjektet og prioritere hvilke hypoteser som bør testes videre i laboratoriet.
I CASP14 var AlphaFold den klart beste metoden for strukturprediksjon. Systemet har fortsatt begrensninger, men nøyaktigheten er ofte konkurransedyktig med eksperimentelle data.
Norske universiteter, sykehus og biotek-selskaper kan bruke datasettet i arbeid med antibiotikaresistens, infeksjonssykdommer, marin biologi, landbruk og persontilpasset medisin.
Basen dekker store deler av UniProt, inkludert menneskeproteomet, nøkkelorganismer for global helse og den manuelt kuraterte Swiss-Prot-delen.
AlphaFold DB tar nå imot store samfunnsdatasett fra forskningsmiljø med dyp domenekunnskap. Det fyller kunnskapshull, spesielt for organismer med begrensede sekvensdata.
17M+ bakterielle prediksjoner tilgjengelig i databasen.
Parasittstrukturer som styrker forskning på tropiske sykdommer.
435 000+ virusrelaterte prediksjoner for bedre kartlegging av virusbiologi.
Data i AlphaFold DB er tilgjengelig for akademisk og kommersiell bruk under CC-BY-4.0. Ved bruk forventes tydelig attribusjon i tråd med god vitenskapelig praksis.
Spørsmål som ikke dekkes i FAQ kan sendes til alphafold@deepmind.com. EMBL-EBI tilbyr også kurs og webinarer om hvordan strukturprediksjoner kan tolkes og brukes i praksis.
Modellen bruker mønstre i aminosyresekvenser og evolusjonære signaler for å estimere en sannsynlig 3D-struktur.
Databasen oppdateres løpende, men du kan også kjøre egne prediksjoner med åpen kildekode som støtter multimerer.
Ja. PAE-data kan lastes ned sammen med strukturinformasjonen og brukes for å vurdere usikkerhet i prediksjonen.
Nyttige norske og internasjonale ressurser for deg som vil lære mer om språkmodeller, verktøy og praktisk KI-bruk.
En norsk inngang til språkmodeller og KI med forklaringer, begreper og eksempler som gjør teknologien lettere å forstå for norske brukere.
Samleside for LLM-relaterte ressurser som kan være nyttig når du vil utforske verktøy, modeller og praktisk bruk av generativ AI.
Her finner du et bredt utvalg av nyttige lenker om AlphaFold, proteinstruktur og relaterte verktøy.
Ønsker du en norsk app for å sende krypterte dokumenter?
Last ned Trygg-appen